François à Rome
Cette chapelle montre le moment où François présente au pape une "règle", c'est-à-dire une liste de normes pratiques pour réglementer la vie et la direction spirituelle de la communauté religieuse qu'il a fondée.
Le pape Innocent III, après quelques hésitations, approuve la règle en 1210, à un moment particulièrement houleux de l'histoire de l'Église. Certains mouvements religieux populaires, tels que ceux des Patarins et des Cathares, dénoncent les richesses matérielles, promeuvent une vie ascétique et une réforme morale de l'Église. Beaucoup d'entre eux furent qualifiés d'hérétiques et leurs adeptes condamnés au bûcher. François risquait lui aussi de subir le même sort, précisément parce qu'il défendait des idées radicales et innovantes et qu'il savait communiquer avec simplicité aux membres les plus fragiles de la société.
Innocent III, cependant, se rendit compte qu'il était nécessaire d'encourager la prédication des groupes religieux fidèles au pape : en approuvant la règle, il tenta de réglementer et de mettre sous contrôle strict l'ordre naissant fondé par François.