Le Sanctuaire de Santa Maria del Monte, tel que vous pouvez le voir aujourd'hui, est le résultat d'importantes interventions du 12ème siècle à nos jours. La première disposition de l'église, à l'époque romane, était une nef unique. Au milieu du XVe siècle, le sanctuaire a été agrandi par l'ajout de deux nefs latérales à la demande du duc de Milan, Galeazzo Maria Sforza. Enfin, au XVIIe siècle, toutes les peintures et décorations ont été renouvelées, y compris l'imposant autel qui abrite toujours la statue en bois de la Vierge noire du XIVe siècle.
Le sanctuaire est étroitement lié au monastère cloîtré : au milieu de la nef, au-dessus de l'arc, on peut voir les grilles depuis lesquelles les religieuses suivent les célébrations religieuses sans enfreindre la règle du cloître.